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親和層析是一種非常有效的蛋白質(zhì)純化方法。其分離機制是基于蛋白質(zhì)和某些特定分子具有特異性的相互作用。除了生物特異性配套外（如酶底物、抗體、受體等），一些俗稱為類生物配體（如凝集素、染料）的物質(zhì)也用在親和層析中，而在固定化的金屬離子上進行的類親和層析在蛋白質(zhì)和多肽的分離純化工作中越來越重要。親和層析的選擇性和效率極高。